महाविद्यालय की स्थापना 13 अप्रैल 1965 में अवधूत मण्डल आश्रम ट्रस्ट, हरिद्वार के महन्त परमश्रद्धेय श्री गुरुचरणदास जी महाराज ने की थी। महाविद्यालय को भूमि और भवन ट्रस्ट की ओर से उन्हीं के करकमलों से मिला था।
यह महाविद्यालय सम्पूर्णानन्द संस्कृत विश्वविद्यालय, वाराणसी का कवर्गीय महाविद्यालय था। विद्वान् प्राध्यापकों के परिश्रम से कुछ ही वर्षों में महाविद्यालय की कीर्ति सर्वत्र प्रसारित होने लगी। सन् 1978 में यह महाविद्यालय भारत सरकार द्वारा संचालित आदर्श संस्कृत पाठशाला योजना के अन्तर्गत चयनित हो गया। तत्पश्चात् सन् 1995 से भारत सरकार ने आदर्श महाविद्यालयों का कार्य राष्ट्रीय संस्कृत संस्थान को प्रदान कर दिया। वर्तमान में यह महाविद्यालय केन्द्रीय संस्कृत विश्वविद्यालय, नई दिल्ली से अनुशासित, अनुदानित एवं सम्बद्ध है।
महाविद्यालय के अध्यक्ष एवं प्राचार्यों की सूची निम्नवत् है –
| क्र.सं. | अध्यक्ष | कार्यकाल |
| 1 | डॉ. के वी शर्मा | 01/07/1978 – 03/06/1985 |
| 2 | प्रो. रसिक विहारी जोशी | 04/06/1985 – 30/11/1994 |
| 3 | प्रो. राममूर्ति शर्मा | 01/12/1994 – 20/07/1995 |
| 4 | श्री जीवनदास मलिक | 21/07/1995 – 18/11/2001 |
| 5 | डॉ. ए.एस. बलदेव राज शर्मा | 19/11/2001 – 18/03/2005 |
| 6 | प्रो. श्रीधर वशिष्ठ | 19/03/2005 – 18/03/2008 |
| 7 | प्रो सत्यप्रकाश सिंह | 16/05/2008 – 15/05/2011 |
| 8 | प्रो सुधा रानी पांडे | 06/06/2011 – 05/06/2014 |
| 9 | प्रो महावीर अग्रवाल | 01/03/2016 – 20/11/2020 |
| 10 | प्रो सत्यदेव निगमालंकार | 21/11/2020 – 04/03/2021 |
| 11 | प्रो वेदप्रकाश उपाध्याय | 05/03/2021 – 31/08/2021 |
| 12 | प्रो -बिहारी लाल शर्मा | 01/09/2021 – वर्तमान तक |
| क्र.सं. | प्राचार्य | कार्यकाल |
| 1 | पं. श्री ब्रह्मदेव झा | 01/07/1965 – 30/06/1968 |
| 2 | श्री स्वामी हरप्रकाश जी (के.वी.) | 01/07/1968 – 31/10/1968 |
| 3 | पं. श्री वेदानन्द झा | 01/11/1968 – 30/04/1973 |
| 4 | श्री स्वामी हरप्रकाश जी (के.वी.) | 01/05/1973 – 18/07/1973 |
| 5 | पं. श्री पूर्णचंद्र उपाध्याय: | 19/07/1973 – 18/08/1975 |
| 6 | पं. श्री राजाराम उनियाल (के.वी.) | 19/08/1975 – 31/08/1975 |
| 7 | पं. श्री मनसा राम शास्त्री | 01/09/1975 – 30/06/1983 |
| 8 | पं. श्री राजाराम उनियाल (के.वी.) | 01/07/1983 – 23/10/1983 |
| 9 | डॉ. अभेदानंद भट्टाचार्य: | 24/10/1983 – 25/10/1986 |
| 10 | पं. श्री राजाराम उनियाल: (के.वी.) | 26/10/1996 – 30/06/1998 |
| 11 | पं. श्री खेमानन्द सती (के.वी.) | 01/07/1998 – 16/02/2001 |
| 12 | डॉ. भोला झा | 17/02/2001 – 31/08/2020 |
| 13 | डॉ. निरंजन मिश्र: (प्र.) | 01/09/2020 – 21/07/2021 |
| 14 | डॉ. ब्रजेन्द्र कुमार सिंहदेव (प्र.) | 22/07/2021 – वर्तमान तक |